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國內新三板市場的擴容，因為主辦券商等機構的壟斷，私募機構參與新三板的主要方式是借助投資新三板企業、或者推動已投資企業掛牌新三板。那么私募股權參與新三板與主辦券商的運行模式有什么不一樣?新三板掛牌的私募股權模式是什么?
目前私募股權機構的主要運作模式：
掛牌前投資
流程：掛牌前投資項目——新三板掛牌——轉板上市。
投資業務是私募股權機構業務的源頭，因此掛牌的數量和質量都尤為重要。所以，盡管新三板擴容取消了對擬掛牌企業盈利等方面的要求，但是私募股權機構仍然會選擇具有獨特盈利模式或者具有創新型業務的中小企業進行投資。根據新三板掛牌企業2014年年報來看，新三板掛牌公司中質地較為優良的做市公司明顯高于協議轉讓公司，數據顯示，做市掛牌公司2014年營收增速為11%，高于新三板整體10%的水平和協議板塊7%的水平;從凈利潤增速來看，做市掛牌公司2014年凈利潤增速為34%，高于新三板整體23%的水平和協議轉讓板塊16%的水平。而做市股票的表現也是水漲船高，成為高價股集中營。
所以，私募股權機構為了能在企業掛牌新三板后能夠有較高估值退出，挑選獨特盈利模式的公司尤為重要。目前，市場中私募股權機構普遍做法是在某幾個行業內進行分析和考察，在關注企業財務指標以外，對企業管理層的水平也在進行判斷。總之，挑選一個優秀的項目，需要專門的投研部門進行必要的客觀分析，多方論證，才能最終獲得。
在投資之后PE機構要能真正幫助企業獲得實實在在的管理改善和價值提升。其后的任務就是將企業推向新三板，在企業掛牌后，知名度及估值的上升更容易吸引市場資本投入，而此時部分PE機構已經可以選擇退出。
目前多數投資機構仍在等待新三板轉板制度的推行，以期望獲得更高估值退出。根據市場數據顯示，截止2015年6月30日，創業板整體市盈率為107倍，而新三板評價市盈率為47倍，兩者之間仍有較大差距。所以，在轉板制度尚未推出時，私募股權機構的收益會受到很大限制。
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