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對企業進行估值的目的是確定企業的內在價值，這是股權投資過程中的一個核心問題。從理論上來講，企業的估值方法主要有絕對估值法和相對估值法。絕對估值法主要是運用貼現的方法確定企業價值，細分起來主要有：現金流量貼現法、股利貼現法(DDM)和收益貼現法;相對估值法則主要分為可比交易法和可比公司法。
股權投資不同階段，被投資企業處于不同的發展時期，其運營狀況和盈利狀況不同決定了應當運用不同的估值方法來確定企業的內在價值。
1.天使投資階段
這個階段的投資對象多為剛剛成立或正在籌備的企業，商業模式和盈利模式尚未形成。天使投資為企業注入的是一筆啟動資金。因此天使投資階段一般不適用任何量化估值方法，投入的資金在企業中所占股權比例一般由天使投資人根據以往經驗與創業者協商確定。
2.VC階段
VC階段被投資企業一般來說已有確定的商業模式，需要大量資金來擴大產能進而增加市場占有率。這個階段的企業大部分沒有形成穩定的盈利和現金流，因此相對估值法是比較適用的估值方法。其中可比交易法較可比公司法更為適用。因為可比公司法需要找到相同類型并有市場公允價值的標的公司，處于成長期的未上市企業很難尋求其公允估值;而可比交易法則可以根據近期發生過交易的相同類型公司估值來確定被投公司估值，當今股權投資的快速發展、投資數量的增多使可比交易更加易于尋找。至于具體估值指標的運用，則主要有PE(市盈率)、PB(市凈率)、PS(市銷率)以及EV/EBITDA(企業價值倍數)四種。一般輕資產的企業不適用PB指標，未形成穩定盈利的企業不適用PE指標，具體運用那一種指標要根據被投資企業的性質來決定。
相對估值法的優勢是可以對沒有形成穩定盈利的公司進行估值，但劣勢是只能確定企業間的相對價值而無法確定絕對價值，也就是說如果用來對比的對象本身估值就出現偏差，則本企業的估值也會出現偏差。為降低偏差，一般會以多個對比對象的平均值作為估值指標。
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